Весной 1966 г. аппарат "Алюминаут" принял участие в поисках водородной бомбы у берегов Испании близ Паломареса. Зона шельфа в районе поиска имела сложный рельеф и была сильно изрезана подводными каньонами. Во время очередного погружения, находясь на глубине 540 м, аппарат опустился на крутой склон шельфа, чтобы определить скорость подводного течения.
Очевидно, из-за неточного учета собственной плавучести "Алюминаут" заскользил по склону и, проваливавшись по каньону на 240 м, погрузился в ил. Чтобы оторваться, пришлось отдать весь балласт. Аппарат всплыл на поверхность, неся на корпусе 1600 кг ила.
В том же году "Алюминаут", проводя испытания в районе устья р. Коннектикут, перешел границу слоев воды с резким различием плотности на глубине около 40 м. Получив внезапно значительную отрицательную плавучесть (как показали впоследствии расчеты - 1580 кг), аппарат стал быстро погружаться. Только продувка балластных цистерн, включение на полную мощность вертикального винта, сброс аварийного балласта и в последний момент - гайдропа, т. е. все меры, которые мог предпринять экипаж, предотвратили удар о грунт и повреждение аппарата.
В не менее опасной ситуации оказался "Алюминаут" в августе 1968 г. во время погружения в Атлантическом океане у о. Векуес Айленд. На глубине 1880 м в результате короткого замыкания сгорело уплотнительное кольцо в кабельном вводе. Герметичность ввода была нарушена - через образовавшееся щелевое отверстие внутрь прочного корпуса ударила струя воды. Экипаж предпринял меры для экстренного всплытия, включая сброс аварийного балласта, и "Алюминаут" благополучно появился на поверхности.
Пострадавшее от воды некоторое оборудование аппарата (воды поступило около 50 кг) потребовало незначительного ремонта.
В августе 1969 г. "Алюминаут" участвовал в операции по подъему затонувшего в Атлантическом океане (юго-восточнее порта Вудс-Холл, штат Массачусетс) подводного аппарата "Элвин". При одном из погружений, после 12 ч непрерывной работы на глубине 1530 м, содержание углекислого газа внутри прочного корпуса "Алюминаута" достигло предела. Работа была прекращена. После срочного всплытия обнаружили, что пробита изоляция обмотки электродвигателя масляного насоса.